博物馆分为 12 个主题区，包括儒艮在内的 1200 多种海洋和河流生物被饲养在一个生动活泼、充满自然气息的环境中。

日本唯一的鲸鱼博物馆。
博物馆主楼展出了 1000 多件鲸鱼骨骼标本和与捕鲸有关的资料。馆内还设有表演池、自然池和海洋水族馆。这里既是博物馆，也是水族馆，游客可以在这里了解鲸鱼。

以环太平洋火山带（火环）为主题。世界上最大的水族馆之一，大规模再现了环太平洋地区的自然环境。游客可以尽情享受仿佛在太平洋海底漫步的氛围。世界上最大的鱼类--鲸鲨在等着您。