博物館分為 12 個主題區域，飼養了包括儒艮在內的 1,200 多種海洋和河流生物，環境生動活潑，充滿自然風情。

日本唯一以鯨魚為主題的博物館。
博物館的主建築展示了 1,000 多個鯨魚骨骼標本和捕鯨相關資料。館內還設有表演池、自然池和海洋水族館。這裡既是博物館，也是水族館，遊客可以在此瞭解鯨魚。

以環太平洋火山帶（火環）為主題。世界上最大的水族館之一，以宏偉的規模再現了環太平洋的自然環境。參觀者可以享受彷彿在太平洋海底漫步的氣氛。世界上最大的魚種鯨鯊在等著您。